Эмери открылась тесная камера, откуда можно было спуститься в подземные ходы, расположенные на еще большей глубине. По обеим сторонам главного коридора находились прямоугольные ниши, высеченные в скальном грунте. В каждой нише стоял деревянный сундук, внутри которого лежала обернутая повязками мумия павиана. Ступни животных были погружены в известь или гипс, — вероятно, для того, чтобы прямоугольные деревянные саркофаги были более устойчивыми.
Главный ход, достигавший в длину 200 м, шел в юго-восточном направлении и заканчивался продолговатым помещением без ниш. Эмери и его спутники осветили зал лампами и увидели крутую лестницу. 

Она вела в еще более глубокое подземелье, бесконечно долго тянущееся в направлении с востока на запад. Ниши здесь лепились одна к другой, как жемчужины в ожерелье, и в каждой нише находился вертикально стоящий деревянный ящик с мумифицированным павианом. Когда Эмери распорядился убрать строительный мусор из верхней галереи, рабочие натолкнулись на слепки частей человеческого тела. Здесь были гипсовые руки, ноги, головы и даже парики.

 Французский египтолог Жан-Филипп Лауэр, бывший в свое время сотрудником Уолтера Эмери, а потом ставший одним из крупнейших знатоков Саккары, в этой связи отмечал:
«Несомненно, здесь мы имели дело с «медицинскими заклинаниями», помещенными сюда паломниками, которые искали исцеления. Цель их могла заключаться как в том, чтобы сообщить богу о своей болезни в соответствующей части тела, так и в том, чтобы таким образом выразить свою благодарность за уже свершившееся исцеление».
Эмери распорядился, чтобы галереи с мумиями павианов продолжали очищать от мусора. Он предполагал, что его ждут новые сюрпризы. Уолтер Эмери был неутомимым археологом, всегда готовым вести раскопки, и, подобно Огюсту Мариету, обладал чутьем на открытия. И оно его не подвело. В расположенном на большей глубине ярусе подземелья с мумиями павианов была обнаружена ниша, служившая соединительным проходом в новые комплексы подземных лабиринтов. Один из этих ходов был «снизу доверху заполнен мумиями ибисов в неповрежденных керамических кувшинах. Тысячи этих мумий загораживали проход» . Во время раскопок 1970–1971 гг. экспедицией Эмери были найдены мумии хищных птиц.

 Общее количество мумий орлов, соколов, коршунов, воронов и ворон можно было оценить лишь приблизительно. Такой специалист как Жан-Филипп Лауэр, знающий гигантскую сеть подземных ходов не понаслышке, говорит о количестве, которое «несомненно, могло достигать нескольких миллионов» . Всего, насколько известно в настоящее время, египтяне почитали как священных и мумифицировали 830 видов птиц.
Эмери был уверен в том, что эти ходы каким-то образом связаны с надземными постройками, относящимися ко времени III династии (2649–2575 до н. э.). Судьба, однако, не позволила ему доказать свою правоту. 

В ходе работ, целиком и полностью захвативших Эмери, у него случился инсульт.